Genderdiversiteit en genderdysforie komen vaker voor bij mensen met autisme dan bij mensen zonder autisme. Hoewel dit een minderheid van de jongeren en volwassenen met autisme betreft, kan een vraag over genderidentiteit of de ervaring dat de eigen genderidentiteit niet overeenkomt met het toegewezen geslacht bij de geboorte invloed hebben op iemands welbevinden.